(1) Возможно ли при подаче документов на визу информацию о яхте вообще не указывать, а предоставить бронь отеля (после получения визы бронь отменить)? -- Да, возможно.
(2) Не возникнет ли проблем потом? в том числе при дальнейших запросах Шенгена? -- Да, проблемы вполне могут возникнуть, например, когда отель, в котором Вы отмените бронь, сообщит об этом в консульство и пограничные структуры. А могут и не возникнуть.
В одном случае Вас могут вежливо попросить зайти в консульство (где Вашу визу аннулируют, что предпочтительно, ибо тогда Вы ещё успеете сдать билеты), в другом Вы узнаете об этом при въезде в страну. Третий случай относится к последующим запросам Шенгена.