В таком случае рекомендовал бы:
1 день Вильнюс
2 день Каунас
3 день Клайпеда
4 день Тракай
Чтобы успеть побывать в каждом городе без своего транспорта и в спокойном ритме, лучше всего на ночлег оставаться в новом месте, а не возвращаться каждый день в Вильнюс (так сэкономите и силы, и время, и деньги на обратный путь).
В Вильнюсе кроме всего прочего советовал бы посетить телевизионную башню. Это уникальное место и вида, который открывается оттуда, вы не найдёте более нигде в городе. Там на высоте 165 метров находится кафе-бар, заказываете что-нибудь себе и вращаетесь по кругу, любуясь городом с высоты птичьего полёта.
В Клайпеде, если не закрылось, то тоже есть подобное местечко. Не телебашня, не 165 метров, но всё же. Там есть 2 оранжевых "небоскрёба", на 21 этаже одного из которых тоже кафе, правда там ничего не вращается, но вид открывается на море, пристань. Найти здания легко т.к. их видно практически отовсюду в городе.