Я была в Токио, но уже давно в 2009 году и всего три дня. Поскольку так случилось, что группа не собралась, я была одна в сопровождении гида. Проездных не было, гид покупала билеты на поездку. Поэтому не знаю, хорошо ли это.
Читала сообщение от 18 февраля, что в этом году сакура зацвела рано, но это в районе реки Кавадзу, южнее Токио. Так что можете и не застать. Но в любом случае расстраиваться не стоит.
В Токио посмотрите район Асакуса (там знаменитый храм) , Одайбо- современный район с развлекательными заведениями, очень интересным выставочным центром Тойоты. На кораблике по реке и на надземном метро без водителя.
В Хаконе меня должны были везти на один день, причем с Фудзиямой и термальными источниками, не попала, помешал тайфун, поезда не ходили. Значит можно на один день.
Съездите в Никко (там храмы) и водопад Кегон, очень красивые места, парковая зона.
Жила я в районе вокзала Синдзюку, там же метро. В этом районе современные здания, можно подняться на смотровую площадку в городской ратуше, туда доступ был свободный. Обо всем у меня здесь есть отзывы.
Не думаю, что я вам сильно помогла, все-таки давно дело было.